Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms