Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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