Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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Sh3bp1P55194 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Sh3bp1P55194 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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Sh3bp1P55194 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms