Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms