Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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