Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxrbP28704 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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