Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RxraP28700 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RxraP28700 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms