Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Top3a-202ENSMUST00000102668 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Zfp74-201ENSMUST00000032797 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr1350-202ENSMUST00000207221 1521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm10482-202ENSMUST00000189825 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm44721-201ENSMUST00000206978 472 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC151982.1-201ENSMUST00000223546 464 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Cpeb1os1-201ENSMUST00000207156 2112 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Patj-207ENSMUST00000107034 4799 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC160340.1-201ENSMUST00000222952 3964 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Napg-201ENSMUST00000025474 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mlip-210ENSMUST00000184322 2668 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Tro-205ENSMUST00000151403 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.2 ms