Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
P10404 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm30270-201ENSMUST00000202675 524 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms