Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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