Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms