Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-M5A7VMS3 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-M5A7VMS3 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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