Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms