Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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