Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms