Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms