Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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