Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms