Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms