Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde1bQ01065 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms