Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Irx1P81068 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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