Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Hoxd13P70217 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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