Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Rai14-202ENSMUST00000169385 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Rnf125-201ENSMUST00000050004 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm35608-201ENSMUST00000218472 2370 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Pkd2l2-201ENSMUST00000014647 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm38947-201ENSMUST00000209940 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Arl6-201ENSMUST00000023405 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Cd68-202ENSMUST00000108654 1008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Mir5625-201ENSMUST00000176598 80 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm10043-201ENSMUST00000210691 235 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm8838-201ENSMUST00000212978 541 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Vmn2r-ps91-201ENSMUST00000213039 784 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm5560-201ENSMUST00000086918 892 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Acad11-207ENSMUST00000189998 2030 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Zfp541-203ENSMUST00000210805 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Acp1-201ENSMUST00000062740 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtbrP50284 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 2610008E11Rik-201ENSMUST00000039271 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Arhgef10l-205ENSMUST00000105798 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Cep41-201ENSMUST00000031810 3447 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Pax3-202ENSMUST00000087086 3863 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Fbxo9-201ENSMUST00000001402 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Gm37065-203ENSMUST00000192498 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtbrP50284 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms