Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprkP35822 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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