Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms