Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Ccl20O89093 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Ccl20O89093 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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