Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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