Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc166S4R181 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc166S4R181 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms