Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer1Q9Z2Y3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms