Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcniQ9Z2V9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CcniQ9Z2V9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms