Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd2Q9Z2E1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms