Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms