Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tulp1Q9Z273 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tulp1Q9Z273 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms