Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sumo3Q9Z172 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo3Q9Z172 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms