Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApipQ9WVQ5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApipQ9WVQ5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms