Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit3Q9WVB4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit3Q9WVB4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms