Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms