Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms