Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scnn1bQ9WU38 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms