Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TapbpQ9R233 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms