Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmed2Q9R0Q3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed2Q9R0Q3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms