Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SrpxQ9R0M3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpxQ9R0M3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SrpxQ9R0M3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SrpxQ9R0M3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpxQ9R0M3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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