Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf346Q9R0B7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf346Q9R0B7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf346Q9R0B7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf346Q9R0B7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf346Q9R0B7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms