Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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