Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms