Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms