Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh11Q9QYF1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Rdh11Q9QYF1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Rdh11Q9QYF1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Rdh11Q9QYF1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Rdh11Q9QYF1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Rdh11Q9QYF1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rdh11Q9QYF1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rdh11Q9QYF1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Rdh11Q9QYF1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Rdh11Q9QYF1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh11Q9QYF1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Rdh11Q9QYF1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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