Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms