Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nufip1Q9QXX8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms