Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limd1Q9QXD8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms